La Directiva 2006/7/CE del Parlamento Europeo sobre las aguas de baño solo exige el control de dos parámetros bacteriológicos: Escherichia coli y enterococos intestinales. Ambas bacterias indican la contaminación fecal de una masa de agua. Dado que se encuentran de forma natural en los sistemas digestivos humanos y animales, su presencia indica la probable presencia de otros gérmenes patógenos. Cuanto mayor es la concentración de Escherichia coli y enterococos intestinales, mayor es el riesgo para la salud.

En España, el agua de las playas es analizada por las Autoridades Sanitarias Autonómicas, a través de los laboratorios de Salud Pública de cada Comunidad Autónoma (CA). Se toman muestras del agua de forma periódica (al menos cada quince días) durante la temporada de baño, que es designada por cada CA. Los resultados de estos análisis son enviados al Ministerio de Sanidad, quien los recopila y publica en el Sistema de Información Nacional de Aguas de Baño, Náyade. 

Los análisis bacteriológicos realizados por las CA facilitan la toma de decisiones al permitir evaluar el riesgo de contaminación del agua. La prohibición del baño en playas con agua contaminada la decreta la autoridad sanitaria local o municipal, que puede ser el propio ayuntamiento o la delegación de salud competente en la zona. Esta autoridad toma la decisión basándose en los controles sanitarios y análisis que se realizan del agua, y que determinan si existen riesgos para la salud de las personas debido a la contaminación.